Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Meis1Q60954 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Meis1Q60954 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms