Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sin3aQ60520 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sin3aQ60520 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sin3aQ60520 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms