Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZM2

RRAGB, Ras-related GTP-binding protein B, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGBQ5VZM2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RRAGBQ5VZM2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RRAGBQ5VZM2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms