Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWI1

TCERG1L, Transcription elongation regulator 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCERG1LQ5VWI1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCERG1LQ5VWI1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCERG1LQ5VWI1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms