Protein–RNA interactions for Protein: Q5T890

ERCC6L2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6L2Q5T890 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ERCC6L2Q5T890 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ERCC6L2Q5T890 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms