Protein–RNA interactions for Protein: Q4KML4

Abracl, Costars family protein ABRACL, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbraclQ4KML4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
AbraclQ4KML4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
AbraclQ4KML4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms