Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
D13Ertd608eQ3UPR8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms