Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc177Q3UHB8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc177Q3UHB8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms