Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cops9Q3U898 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cops9Q3U898 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms