Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem52bQ0VBF2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem52bQ0VBF2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms