Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4DQ08499 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4DQ08499 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms