Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dnal1Q05A62 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dnal1Q05A62 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms