Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc2Q05020 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoc2Q05020 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms