Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ccl7Q03366 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccl7Q03366 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms