Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Scn1bP97952 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scn1bP97952 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms