Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cbx1P83917 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cbx1P83917 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cbx1P83917 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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