Protein–RNA interactions for Protein: P70327

Tbx6, T-box transcription factor TBX6, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx6P70327 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tbx6P70327 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tbx6P70327 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms