Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stra8P70278 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stra8P70278 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Stra8P70278 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stra8P70278 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Stra8P70278 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms