Protein–RNA interactions for Protein: P70232

Chl1, Neural cell adhesion molecule L1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chl1P70232 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chl1P70232 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chl1P70232 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chl1P70232 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chl1P70232 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chl1P70232 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Chl1P70232 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms