Protein–RNA interactions for Protein: P70166

Cpeb1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb1P70166 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cpeb1P70166 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cpeb1P70166 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms