Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PtnP63089 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtnP63089 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtnP63089 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtnP63089 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtnP63089 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtnP63089 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtnP63089 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtnP63089 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtnP63089 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtnP63089 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtnP63089 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtnP63089 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtnP63089 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtnP63089 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtnP63089 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtnP63089 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtnP63089 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtnP63089 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtnP63089 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtnP63089 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PtnP63089 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PtnP63089 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PtnP63089 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms