Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rps3P62908 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rps3P62908 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms