Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl39P62892 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl39P62892 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms