Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdcd5P56812 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pdcd5P56812 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms