Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YJL047C-A	YJL047C-A	135 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YLR307C-A	YLR307C-A	264 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	THI80	YOR143C	960 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	ULP1	YPL020C	1866 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	SNQ2	YDR011W	4506 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	IOC3	YFR013W	2364 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YBR238C	YBR238C	2196 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	BCS1	YDR375C	1371 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	GYP6	YJL044C	1377 nt		3.51	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	SST2	YLR452C	2097 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YDR131C	YDR131C	1671 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	TCP1	YDR212W	1680 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YDR149C	YDR149C	708 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	PEX10	YDR265W	1014 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	BSC2	YDR275W	708 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YGL218W	YGL218W	651 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	MET14	YKL001C	609 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	RPS10A	YOR293W	318 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YPL109C	YPL109C	1974 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	MON1	YGL124C	1935 nt		3.5	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	GIS4	YML006C	2325 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	ENT5	YDR153C	1236 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	BUD16	YEL029C	939 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	PUG1	YER185W	912 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	ERJ5	YFR041C	888 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	LST7	YGR057C	729 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	GCD14	YJL125C	1152 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YLR339C	YLR339C	552 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	OST6	YML019W	999 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	CSM3	YMR048W	954 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	RIM11	YMR139W	1113 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	MRPL17	YNL252C	846 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YBR116C	YBR116C	528 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YGR117C	YGR117C	1431 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	GPI1	YGR216C	1830 nt		3.49	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	DOA4	YDR069C	2781 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	SRB7	YDR308C	423 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	LSM4	YER112W	564 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	RPL22B	YFL034C-A	369 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	LIF1	YGL090W	1266 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YGL138C	YGL138C	1038 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	TAN1	YGL232W	870 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	SMD3	YLR147C	306 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	GPN3	YLR243W	819 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	SAM37	YMR060C	984 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	FMP41	YNL168C	780 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	DER1	YBR201W	636 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YIG1	YPL201C	1386 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YJR061W	YJR061W	2808 nt		3.48	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	MSD1	YPL104W	1977 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	AUS1	YOR011W	4185 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	Q0255	Q0255	1419 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	MSS4	YDR208W	2340 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	MSR1	YHR091C	1932 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	KXD1	YGL079W	657 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YGR190C	YGR190C	366 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	FUR1	YHR128W	651 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YVH1	YIR026C	1095 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	RAD33	YML011C	534 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	SPC2	YML055W	537 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YMR310C	YMR310C	954 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	SAS5	YOR213C	747 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	YDL180W	YDL180W	1644 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	ACK1	YDL203C	1872 nt		3.47	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	COM2	YER130C	1332 nt		3.46	□□□□□ -1.85
DSL1	P53847	DET1	YDR051C	1005 nt		3.46	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YGL041W-A	YGL041W-A	465 nt		3.46	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YGL204C	YGL204C	306 nt		3.46	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RPS25A	YGR027C	327 nt		3.46	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	GLO1	YML004C	981 nt		3.46	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YMR141C	YMR141C	309 nt		3.46	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YNL181W	YNL181W	1224 nt		3.46	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YNL320W	YNL320W	855 nt		3.46	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	HNT3	YOR258W	654 nt		3.46	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	SFG1	YOR315W	1041 nt		3.46	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	CUE3	YGL110C	1875 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YDR089W	YDR089W	2610 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	STP2	YHR006W	1626 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RRN6	YBL014C	2685 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RPS8B	YER102W	603 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RPL24B	YGR148C	468 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	CDC12	YHR107C	1224 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	IRC18	YJL037W	675 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	MAK16	YAL025C	921 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RPS8A	YBL072C	603 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RHO5	YNL180C	996 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	SPT14	YPL175W	1359 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	SPO71	YDR104C	3738 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RPN1	YHR027C	2982 nt		3.45	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	RDS2	YPL133C	1341 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	TOP1	YOL006C	2310 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	GCN1	YGL195W	8019 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	ENA5	YDR038C	3276 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	MAK21	YDR060W	3078 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	TDA10	YGR205W	873 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	IGO2	YHR132W-A	396 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	SUI2	YJR007W	915 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YAL034C-B	YAL034C-B	354 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YLR154C-H	YLR154C-H	132 nt		3.44	□□□□□ -1.86
DSL1	P53847	YLR156C-A	YLR156C-A	132 nt		3.44	□□□□□ -1.86

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