Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DAP3P51398 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DAP3P51398 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
DAP3P51398 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms