Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nkx2-1P50220 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nkx2-1P50220 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms