Protein–RNA interactions for Protein: P48428

Tbca, Tubulin-specific chaperone A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcaP48428 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TbcaP48428 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TbcaP48428 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TbcaP48428 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TbcaP48428 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TbcaP48428 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms