Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rab11bP46638 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rab11bP46638 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms