Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mmp9P41245 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mmp9P41245 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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