Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Traf2P39429 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf2P39429 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf2P39429 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf2P39429 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms