Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SFTPDP35247 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SFTPDP35247 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms