Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Msr1P30204 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msr1P30204 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms