Protein–RNA interactions for Protein: P27782

Lef1, Lymphoid enhancer-binding factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lef1P27782 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lef1P27782 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lef1P27782 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms