Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTX3P26022 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTX3P26022 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTX3P26022 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTX3P26022 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTX3P26022 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTX3P26022 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTX3P26022 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTX3P26022 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTX3P26022 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTX3P26022 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTX3P26022 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTX3P26022 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTX3P26022 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTX3P26022 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PTX3P26022 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTX3P26022 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTX3P26022 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTX3P26022 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTX3P26022 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTX3P26022 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PTX3P26022 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PTX3P26022 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.3 ms