Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prim1P20664 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prim1P20664 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Prim1P20664 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim1P20664 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim1P20664 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Prim1P20664 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Prim1P20664 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Prim1P20664 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms