Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrphP15331 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrphP15331 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrphP15331 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrphP15331 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrphP15331 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrphP15331 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrphP15331 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrphP15331 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrphP15331 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrphP15331 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PrphP15331 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrphP15331 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrphP15331 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrphP15331 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrphP15331 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrphP15331 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrphP15331 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrphP15331 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrphP15331 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrphP15331 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrphP15331 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrphP15331 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrphP15331 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrphP15331 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrphP15331 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PrphP15331 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrphP15331 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PrphP15331 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PrphP15331 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PrphP15331 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PrphP15331 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PrphP15331 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms