Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ACAA1P09110 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ACAA1P09110 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms