Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tk1P04184 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tk1P04184 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tk1P04184 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tk1P04184 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms