Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mtatp6P00848 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtatp6P00848 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms