Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KIF4AO95239 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KIF4AO95239 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KIF4AO95239 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms