Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sap18O55128 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms