Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pole2O54956 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pole2O54956 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms