Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnfsf12O54907 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfsf12O54907 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms