Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkcshO08795 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkcshO08795 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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