Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tcof1O08784 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tcof1O08784 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms