Protein–RNA interactions for Protein: J3QNW5

Gm21797, Predicted gene, 21797, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21797J3QNW5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21797J3QNW5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm21797J3QNW5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Gm21797J3QNW5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21797J3QNW5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gm21797J3QNW5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm21797J3QNW5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm21797J3QNW5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm21797J3QNW5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gm21797J3QNW5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm21797J3QNW5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms