Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
7530416G11RikJ3QJX6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
7530416G11RikJ3QJX6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms