Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vmn1r34G3XA52 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vmn1r34G3XA52 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms