Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U1

Obox6, Oocyte specific homeobox 6, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox6G3X9U1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Obox6G3X9U1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Obox6G3X9U1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms